בנאות קדומים קיים "המרכז ללימודי מנהיגות בטבע לאור המקורות". אחד האמצעים החשובים להפעלת החניכים הוא עדר הצאן, המשמש אמצעי לבחינת כושר המנהיגות:

על המנהיגים הדגולים בישראל, שהיו בנעוריהם רועים, מסופר בהרחבה בספר "מדבר ורועה במורשת ישראל" מאת מייסד נאות קדומים נגה הראובני